客观日本

日本建立人T细胞白血病病毒序列的高精度全新检测方法

2019年10月29日 生物医药

熊本大学人类逆转录病毒学共同研究中心的佐藤贤文教授与佐贺大学胜屋弘雄助教、鹿儿岛大学宇都宫与客座教授、圣玛丽医科大学山野嘉久教授等共同确立了全新的解析方法,能够全方位高精度获取被HTLV-1(人类T细胞白血病病毒)感染细胞中插入的病毒DNA信息。

日本目前约有HTLV-1感染者80万人左右,已知部分感染者会转化成癌症或慢性炎症等其他疾病。HTLV-1病毒感染细胞后会将自己的部分DNA插入整合到宿主细胞DNA中。整合到宿主细胞中的病毒,是这些相关疾病的根本性病原。所以,获取已整合进的病毒DNA信息对相关疾病的诊断及发病机理研究都具有极为重要的意义。

一直以来,为了准确掌握被HTLV-1感染患者的病毒感染病理,需要结合多种解析方法来获取病毒DNA序列全长(判定是否有缺陷型)、病毒DNA的结构、病毒DNA插入位点、被感染细胞的增殖情况等信息。此次研究组建立的全新技术,整合了病毒DNA特异性探针和下一代测序技术,从而实现一次性对病毒信息进行全面高精度的解析(图1)。

日本建立人T细胞白血病病毒序列的高精度全新检测方法

图1 全面高精度解析HTLV-1 DNA的新技术

研究团队进一步采用该新技术,解析了100名日本被感染患者的详细病毒相关信息。除了撰写成论文公开发表,上述病毒信息资源也一并上传到公共数据库以供查阅,希望对后续HTLV-1的研究及相关疾病的诊断有所贡献。

日本建立人T细胞白血病病毒序列的高精度全新检测方法

图2 通过新技术获取的病毒相关信息示例

采用DNA探针和下一代测序技术结合的新方法,不仅适用于HTLV-1的传染病,而且可以依此类推应用于其他癌症相关的病毒传染病领域。本研究成果已于2019年10月15日发表在《Cell Reports》上[文献1]。

参考文献:
1. Katsuya H etc. The nature of HTLV-1 provirus in naturally infected individuals analyzed by viral DNA-capture-seq approach.
Cell Reports. 2019 Oct 15;29(3):724-735.e4.
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.016.

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文:JST客观日本编辑部翻译整理